1. 外部ファイルまでのパス
2. ファイル名の記述間違い
3. スクリプトの記述位置（ヘッダ内でよいのかbody閉じタグ前じゃないといけないのか）
4. 変数名と同じメソッド名を指定してないか
5. 同じ変数名を複数しようしていないか
6. 変数の宣言の箇所は正しいのか
7. メソッド名の指定はあってるか
8. 関数の処理できるデータ型をきちんと指定しているか

などです。デバックはfirefox　+　firebug を使用するとブレークポイントや変数にどんなデータが入っているかをしていできるので良いと思います。